MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 19296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011565	ATA	2	6	40	45	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
2	NC_011565	ATA	2	6	50	55	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
3	NC_011565	AGA	2	6	162	167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
4	NC_011565	TTC	2	6	185	190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550358
5	NC_011565	CAAA	2	8	213	220	75 %	0 %	0 %	25 %	212550358
6	NC_011565	ATT	3	9	238	246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550358
7	NC_011565	AAT	2	6	247	252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
8	NC_011565	AAG	2	6	268	273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
9	NC_011565	ACA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550358
10	NC_011565	T	7	7	384	390	0 %	100 %	0 %	0 %	212550358
11	NC_011565	ATA	2	6	398	403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
12	NC_011565	GGA	2	6	478	483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550358
13	NC_011565	A	6	6	548	553	100 %	0 %	0 %	0 %	212550358
14	NC_011565	ATTT	2	8	575	582	25 %	75 %	0 %	0 %	212550358
15	NC_011565	ATT	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550358
16	NC_011565	CAG	2	6	764	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550358
17	NC_011565	ATA	2	6	787	792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
18	NC_011565	AGA	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
19	NC_011565	A	8	8	870	877	100 %	0 %	0 %	0 %	212550358
20	NC_011565	AGA	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
21	NC_011565	GAA	2	6	919	924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550358
22	NC_011565	A	6	6	1043	1048	100 %	0 %	0 %	0 %	212550358
23	NC_011565	A	9	9	1068	1076	100 %	0 %	0 %	0 %	212550358
24	NC_011565	ATTC	2	8	1144	1151	25 %	50 %	0 %	25 %	212550358
25	NC_011565	A	7	7	1206	1212	100 %	0 %	0 %	0 %	212550358
26	NC_011565	CATG	2	8	1279	1286	25 %	25 %	25 %	25 %	212550358
27	NC_011565	AAT	2	6	1300	1305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550358
28	NC_011565	CAA	2	6	1331	1336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550358
29	NC_011565	GA	3	6	1338	1343	50 %	0 %	50 %	0 %	212550358
30	NC_011565	TCT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550359
31	NC_011565	A	6	6	1797	1802	100 %	0 %	0 %	0 %	212550359
32	NC_011565	ATT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
33	NC_011565	A	6	6	1854	1859	100 %	0 %	0 %	0 %	212550359
34	NC_011565	AACA	2	8	1868	1875	75 %	0 %	0 %	25 %	212550359
35	NC_011565	TAT	3	9	1914	1922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
36	NC_011565	TCA	2	6	1963	1968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550359
37	NC_011565	A	7	7	2023	2029	100 %	0 %	0 %	0 %	212550359
38	NC_011565	AAC	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550359
39	NC_011565	TAA	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550359
40	NC_011565	TTA	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
41	NC_011565	A	6	6	2227	2232	100 %	0 %	0 %	0 %	212550359
42	NC_011565	TTC	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550359
43	NC_011565	A	6	6	2266	2271	100 %	0 %	0 %	0 %	212550359
44	NC_011565	AGA	2	6	2370	2375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550359
45	NC_011565	AACA	2	8	2460	2467	75 %	0 %	0 %	25 %	212550359
46	NC_011565	TAT	2	6	2530	2535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
47	NC_011565	T	6	6	2594	2599	0 %	100 %	0 %	0 %	212550359
48	NC_011565	A	6	6	2602	2607	100 %	0 %	0 %	0 %	212550359
49	NC_011565	TA	3	6	2689	2694	50 %	50 %	0 %	0 %	212550359
50	NC_011565	TGA	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550359
51	NC_011565	GAA	2	6	2929	2934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550359
52	NC_011565	TAA	2	6	2961	2966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550359
53	NC_011565	AAAC	2	8	2999	3006	75 %	0 %	0 %	25 %	212550359
54	NC_011565	TA	3	6	3011	3016	50 %	50 %	0 %	0 %	212550359
55	NC_011565	A	7	7	3165	3171	100 %	0 %	0 %	0 %	212550359
56	NC_011565	GAAAAA	2	12	3226	3237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212550359
57	NC_011565	A	7	7	3233	3239	100 %	0 %	0 %	0 %	212550359
58	NC_011565	TAT	2	6	3240	3245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550359
59	NC_011565	AAG	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550359
60	NC_011565	CAAT	2	8	3345	3352	50 %	25 %	0 %	25 %	212550359
61	NC_011565	AGA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550359
62	NC_011565	ATT	2	6	3517	3522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550360
63	NC_011565	TTC	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550360
64	NC_011565	ATT	2	6	3548	3553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550360
65	NC_011565	CTTTC	2	10	3569	3578	0 %	60 %	0 %	40 %	212550360
66	NC_011565	ATC	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
67	NC_011565	TTC	2	6	3773	3778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550360
68	NC_011565	CAT	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
69	NC_011565	AAT	2	6	3827	3832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
70	NC_011565	ACC	2	6	3842	3847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550360
71	NC_011565	AGC	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550360
72	NC_011565	A	6	6	3872	3877	100 %	0 %	0 %	0 %	212550360
73	NC_011565	ATA	2	6	3919	3924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
74	NC_011565	TTGTA	2	10	3941	3950	20 %	60 %	20 %	0 %	212550360
75	NC_011565	CAT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
76	NC_011565	CCA	2	6	4012	4017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550360
77	NC_011565	TTTA	2	8	4028	4035	25 %	75 %	0 %	0 %	212550360
78	NC_011565	CTG	2	6	4066	4071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550360
79	NC_011565	TCA	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
80	NC_011565	TCAA	2	8	4146	4153	50 %	25 %	0 %	25 %	212550360
81	NC_011565	TAC	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
82	NC_011565	TAAAT	2	10	4340	4349	60 %	40 %	0 %	0 %	212550360
83	NC_011565	TTC	2	6	4352	4357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550360
84	NC_011565	GAT	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550360
85	NC_011565	A	6	6	4448	4453	100 %	0 %	0 %	0 %	212550360
86	NC_011565	GGT	2	6	4470	4475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550360
87	NC_011565	CTA	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550360
88	NC_011565	AAT	2	6	4515	4520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
89	NC_011565	AT	4	8	4541	4548	50 %	50 %	0 %	0 %	212550360
90	NC_011565	TGA	2	6	4556	4561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550360
91	NC_011565	AAT	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
92	NC_011565	CCT	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550360
93	NC_011565	ATT	2	6	4712	4717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550360
94	NC_011565	T	6	6	4716	4721	0 %	100 %	0 %	0 %	212550360
95	NC_011565	AG	4	8	4751	4758	50 %	0 %	50 %	0 %	212550360
96	NC_011565	T	6	6	4823	4828	0 %	100 %	0 %	0 %	212550360
97	NC_011565	T	7	7	4841	4847	0 %	100 %	0 %	0 %	212550360
98	NC_011565	TC	3	6	4870	4875	0 %	50 %	0 %	50 %	212550360
99	NC_011565	GA	3	6	4880	4885	50 %	0 %	50 %	0 %	212550360
100	NC_011565	TAA	2	6	4888	4893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
101	NC_011565	GACT	2	8	4932	4939	25 %	25 %	25 %	25 %	212550360
102	NC_011565	TAT	2	6	5002	5007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550360
103	NC_011565	TC	3	6	5008	5013	0 %	50 %	0 %	50 %	212550360
104	NC_011565	TCT	2	6	5078	5083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550360
105	NC_011565	TAA	2	6	5125	5130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550360
106	NC_011565	TTG	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550360
107	NC_011565	ATAA	2	8	5153	5160	75 %	25 %	0 %	0 %	212550360
108	NC_011565	T	6	6	5236	5241	0 %	100 %	0 %	0 %	212550360
109	NC_011565	A	7	7	5244	5250	100 %	0 %	0 %	0 %	212550360
110	NC_011565	AAT	2	6	5418	5423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
111	NC_011565	CTT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550361
112	NC_011565	GTT	2	6	5434	5439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550361
113	NC_011565	CAA	2	6	5474	5479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550361
114	NC_011565	ATC	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550361
115	NC_011565	T	10	10	5518	5527	0 %	100 %	0 %	0 %	212550361
116	NC_011565	TTA	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550361
117	NC_011565	AAT	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
118	NC_011565	T	7	7	5646	5652	0 %	100 %	0 %	0 %	212550361
119	NC_011565	A	6	6	5659	5664	100 %	0 %	0 %	0 %	212550361
120	NC_011565	TCC	2	6	5700	5705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550361
121	NC_011565	ATC	2	6	5754	5759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550361
122	NC_011565	ATTTT	2	10	5776	5785	20 %	80 %	0 %	0 %	212550361
123	NC_011565	CT	3	6	5820	5825	0 %	50 %	0 %	50 %	212550361
124	NC_011565	TA	3	6	5899	5904	50 %	50 %	0 %	0 %	212550361
125	NC_011565	CCGA	2	8	5910	5917	25 %	0 %	25 %	50 %	212550361
126	NC_011565	ATA	2	6	5942	5947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
127	NC_011565	AAT	2	6	5979	5984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
128	NC_011565	ATC	2	6	5989	5994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550361
129	NC_011565	CTT	2	6	6026	6031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550361
130	NC_011565	TAA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
131	NC_011565	TCTTG	2	10	6229	6238	0 %	60 %	20 %	20 %	212550361
132	NC_011565	AAAGT	2	10	6326	6335	60 %	20 %	20 %	0 %	212550361
133	NC_011565	TAT	2	6	6341	6346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550361
134	NC_011565	ATG	2	6	6354	6359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550361
135	NC_011565	T	6	6	6486	6491	0 %	100 %	0 %	0 %	212550361
136	NC_011565	A	8	8	6492	6499	100 %	0 %	0 %	0 %	212550361
137	NC_011565	AGA	2	6	6510	6515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550361
138	NC_011565	TAA	2	6	6519	6524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550361
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142	NC_011565	CAA	2	6	6684	6689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550361
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258	NC_011565	TTCTT	2	10	11835	11844	0 %	80 %	0 %	20 %	212550363
259	NC_011565	T	7	7	11871	11877	0 %	100 %	0 %	0 %	212550363
260	NC_011565	GATTT	2	10	12134	12143	20 %	60 %	20 %	0 %	212550363
261	NC_011565	ACG	2	6	12215	12220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550363
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263	NC_011565	CAAT	2	8	12332	12339	50 %	25 %	0 %	25 %	212550363
264	NC_011565	AT	3	6	12338	12343	50 %	50 %	0 %	0 %	212550363
265	NC_011565	TTC	2	6	12438	12443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550363
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267	NC_011565	TAC	2	6	12516	12521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
268	NC_011565	ATT	2	6	12532	12537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550363
269	NC_011565	TTC	2	6	12589	12594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550363
270	NC_011565	T	6	6	12666	12671	0 %	100 %	0 %	0 %	212550363
271	NC_011565	T	7	7	12710	12716	0 %	100 %	0 %	0 %	212550363
272	NC_011565	CTC	4	12	12765	12776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550363
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280	NC_011565	CAT	3	9	13115	13123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550363
281	NC_011565	CTT	2	6	13163	13168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550363
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283	NC_011565	TCC	2	6	13188	13193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550363
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288	NC_011565	AGA	2	6	13281	13286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550363
289	NC_011565	CCA	2	6	13393	13398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550363
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301	NC_011565	TA	3	6	13960	13965	50 %	50 %	0 %	0 %	212550363
302	NC_011565	ATT	2	6	14008	14013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550363
303	NC_011565	AAC	2	6	14076	14081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550363
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306	NC_011565	TCT	2	6	14212	14217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550363
307	NC_011565	AT	3	6	14228	14233	50 %	50 %	0 %	0 %	212550363
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309	NC_011565	TACAT	2	10	14317	14326	40 %	40 %	0 %	20 %	212550363
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381	NC_011565	T	6	6	17889	17894	0 %	100 %	0 %	0 %	212550368
382	NC_011565	TTTA	2	8	18098	18105	25 %	75 %	0 %	0 %	212550369
383	NC_011565	CAT	2	6	18123	18128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550369
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391	NC_011565	TTC	2	6	18765	18770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550370
392	NC_011565	AT	3	6	18774	18779	50 %	50 %	0 %	0 %	212550370
393	NC_011565	CTTTA	2	10	18788	18797	20 %	60 %	0 %	20 %	212550370
394	NC_011565	TAA	2	6	18826	18831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550370
395	NC_011565	CTTCA	2	10	18842	18851	20 %	40 %	0 %	40 %	212550370
396	NC_011565	TAA	2	6	18872	18877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550370
397	NC_011565	ACC	2	6	18939	18944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550370
398	NC_011565	T	6	6	18947	18952	0 %	100 %	0 %	0 %	212550370
399	NC_011565	CATC	2	8	19126	19133	25 %	25 %	0 %	50 %	212550370
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